c7c7.app附屬山西省眼科醫院孫斌教授課題組開展基于高通量測序技術及培養組學的眼鼻咽部微生物菌群研究取得新進展
由于眼部、鼻部及口咽部在解剖學上相通,故比較中國人群健康和疾病狀態下眼、前鼻孔和口咽的微生物群落,揭示不同人群眼鼻咽部微生物菌群的生物學信息。
高通量測序結果顯示健康人眼部和鼻部的微生物群落組成相似,與口咽部不同。本研究通過高通量測序技術共獲得38個門,94個綱,215個目,386個科,744個屬。培養組學及分離株基因組研究結果顯示,眼鼻咽部分離培養獲得的26個菌屬和55個菌種中,眼部和鼻部表皮葡萄球菌分離率最高,口咽部唾液鏈球菌分離率最高。ANI和Blast比較發現溶血性葡萄球菌、金黃色葡萄球菌及表皮葡萄球菌在眼鼻咽三個部位基因組相似性高。

圖1健康人眼鼻咽部微生物菌群Beta多樣性(PCA):屬水平
研究表明,高通量測序技術、培養組學和單菌株全基因組測序方法相結合,可較為完整地提供眼鼻咽部微生物群落“屬”、“種”水平分類學特征。建立重點菌種的培養、鑒定和全基因組信息比較技術體系,可實現眼部及鄰近部位菌種的精準溯源。為今后探討眼鼻咽部感染性疾病的發病機制、預防和新型微生態治療提供參考。