12月29日，我校崔永萍團(tuán)隊與山西省腫瘤醫(yī)院病理科和樣本庫團(tuán)隊合作，聯(lián)合中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院腫瘤醫(yī)院劉芝華/焦宇辰團(tuán)隊、深圳灣實驗室詹啟敏院士團(tuán)隊原創(chuàng)合作研究成果《Integrated Multi-omics Profiling Yields a Clinically-Relevant Molecular Classification for Esophageal Squamous Cell Carcinoma》在國際頂級期刊Cancer Cell（IF=38.585）發(fā)表，這是國際上首個基于大樣本和多組學(xué)數(shù)據(jù)對食管鱗癌進(jìn)行分子分型的研究。
該研究納入155例食管鱗癌患者配對樣本進(jìn)行了全基因組、表觀基因組、轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)層面的全面整合分析；利用多組學(xué)分析首次將食管鱗癌分為細(xì)胞周期通路激活型（CCA）、NRF2通路激活型（NRFA）、免疫抑制型（IS）和免疫調(diào)節(jié)型（IM）（圖1）。CCA亞型體現(xiàn)在細(xì)胞周期檢查點基因的變異，而NRFA亞型則有NRF2通路基因的激活。CCA和NRFA亞型患者均具有CpG島甲基化表型（E-CIMP+），并與淋巴節(jié)轉(zhuǎn)移和臨床分期相關(guān)。IS和IM亞型是免疫細(xì)胞高浸潤型，但腫瘤組織浸潤的免疫細(xì)胞類型不同。研究者進(jìn)一步利用43例接受PD-1抗體單藥治療隊列研究，發(fā)現(xiàn)IM亞型對免疫檢查點阻斷療法（ICB）有更好的治療響應(yīng)，并基于該隊列ESCC組織多組學(xué)數(shù)據(jù)開發(fā)了識別IM亞型患者的分子特征分類器。本研究首次基于多組學(xué)數(shù)據(jù)對食管鱗癌進(jìn)行分子分型，并為每個亞型尋找了潛在的治療靶標(biāo)和/或診斷標(biāo)志物，為后續(xù)開展針對食管鱗癌各亞型的藥物研發(fā)及臨床實驗研究，制定出針對不同亞型食管鱗癌的精準(zhǔn)治療提供了可能。
食管鱗癌多組學(xué)分子四分型及其潛在治療靶標(biāo)
食管癌是消化系統(tǒng)高發(fā)惡性腫瘤，在全球發(fā)病率排名第七，死亡率排名第六，我國食管癌發(fā)病率和死亡率均居世界首位，食管鱗癌（ESCC）是食管癌主要的病理類型，其起病隱匿、缺乏有效的診斷標(biāo)志物、惡性程度高，預(yù)后極差。近年來隨著技術(shù)的發(fā)展，已有不同的學(xué)者對食管鱗癌組織的進(jìn)行不同層次的組學(xué)研究，以期闡明食管鱗癌中基因變異及其臨床意義，但其樣本例數(shù)少、觀察視角單一，對臨床治療方案缺乏有效的指導(dǎo)意義。而從多組學(xué)多層面多視角挖掘食管鱗癌的致病機(jī)制，明確其分子分型，尋找相應(yīng)分子亞型的治療靶點，已成為食管鱗癌研究領(lǐng)域的重大研究課題。
崔永萍教授團(tuán)隊多年來潛心致力于食管鱗癌致病機(jī)理研究。2016年在百度基金會的支持下，聯(lián)合中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院腫瘤醫(yī)院分子腫瘤學(xué)國家重點實驗室、深圳灣實驗室、山西腫瘤醫(yī)院等多家單位，共同開展山西及新疆等地的食管鱗癌的大樣本和多組學(xué)研究，先后完成了全球最大的508例食管鱗癌全基因組學(xué)研究（2020年Cell Research IF=46.378）、94例的食管鱗癌蛋白組及磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)研究（2021年STTT IF=38.1）、528例食管鱗癌的基因結(jié)構(gòu)變異研究（2022年Nature communications IF=17.694）以及本次的155例食管鱗癌的多組學(xué)研究，同時對研究中發(fā)現(xiàn)的一系列食管鱗癌相關(guān)基因進(jìn)行了功能和機(jī)制研究，連續(xù)取得了系列原創(chuàng)成果，為闡明食管鱗癌的致病機(jī)制及分子分型、尋找有效的診斷標(biāo)志物、藥物靶點和制定臨床精準(zhǔn)治療方案提供了理論依據(jù)。
原文鏈接：https://www.cell.com/cancer-cell/fulltext/S1535-6108(22)00590-6
（圖文/皇甫亮）
