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中國科學(xué)院:北京基因組所等揭示腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞調(diào)控CD8+ T細(xì)胞命運(yùn)新機(jī)制

發(fā)布時(shí)間:2021/05/26 15:26:42     點(diǎn)擊:305

 

  腫瘤免疫治療為癌癥患者帶來新的治療手段和希望,在多種腫瘤類型中得到了成功應(yīng)用。一部分病人可以響應(yīng)免疫治療并取得理想的治療效果,但大部分病人對免疫治療無法產(chǎn)生響應(yīng)。其中一個(gè)重要原因是其腫瘤微環(huán)境中T細(xì)胞的功能已經(jīng)處于不可逆的失調(diào)狀態(tài)。研究表明,腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞是誘導(dǎo)T細(xì)胞功能失調(diào)的主力軍之一。作為免疫細(xì)胞的一員,巨噬細(xì)胞進(jìn)入腫瘤微環(huán)境中后往往受到腫瘤的影響,轉(zhuǎn)變?yōu)榇龠M(jìn)腫瘤生長并抑制T細(xì)胞功能的狀態(tài),但其調(diào)控機(jī)制尚不清晰。作為真核細(xì)胞中mRNA上豐度最高的修飾類型,m6A修飾可通過影響mRNA的穩(wěn)定性及翻譯效率等過程對細(xì)胞功能進(jìn)行精確調(diào)控。但近期的工作也發(fā)現(xiàn),m6A修飾系統(tǒng)在多種類型腫瘤中處于失調(diào)狀態(tài)。那么,m6A修飾失調(diào)是否影響腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞的功能,并參與其對T細(xì)胞功能的調(diào)控呢?

  5月20日,中國科學(xué)院北京基因組研究所(國家生物信息中心)研究員韓大力課題組聯(lián)合清華大學(xué)免疫研究所研究員徐萌團(tuán)隊(duì),在Cancer Cell上,發(fā)表題為The loss of RNA N6-adenosine methyltransferase Mettl14 in tumor-associated macrophages promotes CD8+ T cell dysfunction and tumor growth的研究論文,揭示了特定腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞亞群通過表觀轉(zhuǎn)錄組層面調(diào)控CD8+ T細(xì)胞功能的新機(jī)制:m6A甲基化酶METTL14在C1q+巨噬細(xì)胞中的喪失,導(dǎo)致巨噬細(xì)胞中Ebi3轉(zhuǎn)錄本上m6A修飾的降低和EBI3表達(dá)量的增加,進(jìn)而誘導(dǎo)腫瘤浸潤的CD8+ T細(xì)胞的功能失調(diào)。

  研究發(fā)現(xiàn),腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞中存在一類C1q+巨噬細(xì)胞亞群,通過表面的免疫調(diào)節(jié)受體和T細(xì)胞相互作用。C1q+巨噬細(xì)胞亞群中富集和m6A修飾相關(guān)的基因(如Mettl14。進(jìn)一步探究m6A修飾在巨噬細(xì)胞中的作用,研究人員發(fā)現(xiàn),在巨噬細(xì)胞中特異性敲除Mettl14小鼠抗腫瘤能力低于野生型小鼠,腫瘤浸潤的CD8+ T細(xì)胞比例顯著下降。單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)表明,與野生型對照組相比,巨噬細(xì)胞中Mettl14的缺失可導(dǎo)致免疫微環(huán)境中浸潤的效應(yīng)性CD8+ T細(xì)胞和耗竭性T細(xì)胞前體細(xì)胞顯著減少,而活化異常且功能失調(diào)的中間態(tài)CD8+ T細(xì)胞顯著增多。功能驗(yàn)證進(jìn)一步說明,巨噬細(xì)胞中Mettl14的缺失導(dǎo)致CD8+ T細(xì)胞的殺傷性功能下降,并且上調(diào)表達(dá)共抑制性受體。這些結(jié)果說明,Mettl14缺失的巨噬細(xì)胞打破了CD8+ T細(xì)胞分化的平衡,即抑制效應(yīng)性CD8+ T細(xì)胞的活化而促使CD8+ T細(xì)胞功能失調(diào)。

  通過整合分析野生型和Mettl14缺失的腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞的m6A-seqRNA-seq數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)Ebi3 mRNA上的m6A修飾水平在Mettl14缺失的巨噬細(xì)胞中顯著降低,Ebi3 mRNA水平和蛋白表達(dá)水平顯著提高。EBI3中和抗體通過挽救Mettl14條件性敲除小鼠中CD8+ T細(xì)胞的殺傷性功能,顯著提高其抗腫瘤能力。結(jié)果表明,Mettl14缺失的巨噬細(xì)胞通過提高EBI3的表達(dá)量誘導(dǎo)CD8+ T細(xì)胞功能失調(diào)。為了探究上述結(jié)論是否適用于病人腫瘤樣本,研究人員首先使用多色免疫組織化學(xué)染色技術(shù),發(fā)現(xiàn)結(jié)腸癌病人的腫瘤樣本中巨噬細(xì)胞與CD8+ T細(xì)胞的臨近位置關(guān)系。此外,腫瘤基質(zhì)中METTL14的表達(dá)量與m6A修飾水平及CD8+ T細(xì)胞的浸潤呈正相關(guān)關(guān)系。腫瘤基質(zhì)的m6A修飾水平高的病人與m6A修飾水平低的病人相比,腫瘤基質(zhì)中浸潤的CD8+ T細(xì)胞效應(yīng)性功能更好。

  綜上,該研究報(bào)道了腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞中RNA m6A修飾的失調(diào)導(dǎo)致EBI3表達(dá)量的上調(diào),促使CD8+ T細(xì)胞功能失調(diào)的新機(jī)制。研究表明,m6A修飾在表觀轉(zhuǎn)錄層面調(diào)控巨噬細(xì)胞的免疫調(diào)節(jié)功能,強(qiáng)調(diào)了巨噬細(xì)胞功能可塑性可通過表觀轉(zhuǎn)錄動態(tài)變化實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)調(diào)控。研究人員提出,靶向Mettl14下游抑制CD8+ T細(xì)胞功能的分子(如EBI3),有望恢復(fù)CD8+ T細(xì)胞功能并提高現(xiàn)有PD-1/PD-L1阻斷抗體療法的響應(yīng)率。

  韓大力和徐萌為論文的共同通訊作者,清華大學(xué)博士生董麗輝、北京基因組所博士生陳傳遠(yuǎn)和張亞偉為論文的共同第一作者。北京基因組所博士后常人葆、博士生梁廣豪和清華大學(xué)博士生郭霈錦、劉弋、李亦林和孫夢雪參與了研究工作。北京大學(xué)腫瘤醫(yī)院教授沈琳團(tuán)隊(duì)、北京大學(xué)研究員劉君、中科院生態(tài)環(huán)境研究中心研究員汪海林和博士賴瑋毅、芝加哥大學(xué)Urszula Dougherty和Marc B. Bissonnette對論文做出貢獻(xiàn)。

  論文鏈接:https://www.cell.com/cancer-cell/fulltext/S1535-6108(21)00224-5

腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞m6A修飾酶Mettl14的降低將上調(diào)Ebi3 mRNA的穩(wěn)定性,提高EBI3的分泌釋放并進(jìn)一步致使CD8+ T cells的功能失調(diào),最終促進(jìn)腫瘤生長

(文章來源:中國科學(xué)院;原文鏈接:http://www.cas.cn/syky/202105/t20210524_4789422.shtml)

 

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