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曹紅艷


曹紅艷

c7c7.app公共衛生學院衛生統計教研室,副教授,碩士生指導教師

E-mail:caohy@sxmu.edu.cn

教育經歷

2019.11-2022.11,美國密歇根州立大學,概率與統計系,博士后

2015.4-2016.4, 美國密歇根州立大學,概率與統計系,訪問學者

2013.9-2017.7, c7c7.app,流行病與衛生統計學,博士

2006.9-2009.7, c7c7.app,流行病與衛生統計學,碩士

2000.9-2004.7, 山西大學,信息與計算科學專業,學士

工作經歷

2017.12-至今,c7c7.app,副教授

2009.8-2017.11,c7c7.app,講師

2004.7-2009.7,c7c7.app,助教

學術任職

全國工業統計學教學研究會健康醫療大數據學會理事,中國衛生信息與健康醫療大數據學會衛生統計學教育專業委員會委員,中國康復醫學學會科技管理與評估委員會第二屆委員會委員,《中國醫院統計》雜志編委,山西省醫學會臨床流行病學和循證醫學專業委員會委員

研究方向

統計遺傳與基因組學,多組學數據整合方法及應用,單細胞和空間轉錄組數據統計建模方法及應用

主持科研項目

1.國家自然科學基金委員會,面上項目,82473739,基于圖注意力網絡整合的肺癌單細胞多組學細胞分型方法研究,2025-01至2028-12,49萬元,在研,主持

2.國家自然科學基金委員會,青年基金,71403156,基于潛在結構分析的出生缺陷人群分布特征和干預策略研究,2015-01至2017-12,19萬元,已結題,主持

3.山西省回國留學人員科研資助項目,2024-081,基于單細胞多組學的腫瘤細胞類型識別研究,2024年06月-2027年06月,6萬元,在研,主持

4.山西省科技廳,自然科學研究面上項目, 202303021211130,基于無監督核融合的多組學數據整合腫瘤分子分型方法研究, 2024-01至2026-12, 8萬元,在研,主持

5.山西省科技廳,自然科學基金,201901D111204,冠心病多系統數據整合分的精準預后模型構建,2019-09至2022-09,5萬元,已結題,主持

6.山西省回國留學人員科研資助項目,2017-054,基于懲罰回歸的縱向數據基因關聯分析,2017-07月-2020-07,2萬元,已結題,主持

教學改革項目

1.山西省高等學校一般性教學改革創新立項項目,線上線下混合課程的潛在結構學情分析,J20230477,2023.8-2025.8,主持。

出版教材

1.醫學統計學,中國協和醫科大學出版社, 2018, 978-7-5679-1038-6,參編

2.醫藥數理統計,科學出版社, 2018, 978-7-03-052786-8,參編

軟著

1.基于網絡增強相似網絡融合的多組學數據整合分型軟件V1.0, 2023

2.基于iCluster系列方法的多組學數據聚類分析管理軟件V1.0,2020

獲獎情況

山西省“三晉英才”支持計劃青年優秀人才,全國大學生統計建模大賽山西賽區選拔賽研究生組二等獎(指導教師),“華為杯”第十七屆中國研究生數學建模競賽三等獎(指導教師)。

部分發表論文

1.Hongyan Cao, Congcong Jia, Zhi Li, Haitao Yang, Ruiling Fang, Yanbo Zhang, Yuehua Cui*. wMKL: multi-omics data integration enables novel cancer subtype identification via weight-boosted multi-kernel learning,British Journal of Cancer. 2024, 130(6): 1001-1012.

2.Shuo Zhang#,Hongyan Cao#, Keying Chen, Tongyu Gao, Huashuo Zhao, Chu Zheng, Ting Wang, Ping Zeng, Ke Wang. Joint Exposure to Multiple Air Pollutants, Genetic Susceptibility, and Incident Dementia: A Prospective Analysis in the UK Biobank Cohort.Int J Public Health. 2024, 69: 1606868.

3.Congcong Jia, Tong Wang, Dingtong Cui, Yaxin Tian, Gaiqin Liu, Zhaoyang Xu, Yanhong Luo, Ruiling Fang, Hongmei Yu, Yanbo Zhang, Yuehua Cui*,Hongyan Cao*. A metagene based similarity network fusion approach for multi-omics data integration identified novel subtypes in renal cell carcinoma.Briefings in Bioinformatics.2024, 25(6): bbae606.

4.Yifang Wei, Lingmei Li, Xin Zhao, Haitao Yang, Jian Sa,Hongyan Cao*, Yuehua Cui*. Cancer subtyping with heterogeneous multi-omics data via hierarchical multi-kernel learning.Briefings in Bioinformatics, 2023, 24(1), bbac488.

5.Jiaying Wang, Yuting Miao, Lingmei Li, Yongqing Wu, Yan Ren*, Yuehua Cui*,Hongyan Cao*, Multi-omics data integration for hepatocellular carcinoma subtyping with multikernel learning.Frontiers in Genetics, 2022, 13:962870.

6.Lingmei Li, Yifang Wei, Guojing Shi, Haitao Yang, Zhi Li, Ruiling Fang,Hongyan Cao*, Yuehua Cui*. Multi-omics data integration for subtype identification of Chinese lower-grade gliomas: a joint similarity network fusion approach.Computational and Structural Biotechnology Journal, 2022, 20: 3482-3492.

7.Yongqing Wu, Huihui Wang, Zhi Li, Jinfang Cheng, Ruiling Fang,Hongyan Cao*, Yuehua Cui*. Subtypes Identification on Heart Failure with Preserved Ejection Fraction via Network Enhancement Fusion using Multi-omics Data[J].Computational and Structural Biotechnology Journal, 2021, 19: 1567-1578.

8.Liye Zhou, Zhifei Guo, Bijue Wang, Yongqing Wu, Zhi Li, Hongmei Yao, Ruiling Fang, Haitao Yang,Hongyan Cao*, Yuehua Cui*. Risk Prediction in Patients With Heart Failure With Preserved Ejection Fraction Using Gene Expression Data and Machine Learning[J].Frontiers in genetics, 2021, 12: 652315.

9.Huihui Wang, Yongqing Wu, Ruiling Fang, Jian Sa, Zhi Li,HongyanCao*, Yuehua Cui*. Time-Varying Gene Network Analysis of Human Prefrontal Cortex Development[J].Frontiers in Genetics, 2020, 11: 574543.

10.Hongyan Cao, Zhi Li, Haitao Yang, Yuehua Cui*, Yanbo Zhang*. Longitudinal data analysis for rare variants detection with penalized quadratic inference function[J].Scientific Reports, 2017, 7(1):650.

11.Hongyan Cao, Xiaoyuan Wei, Xingping Guo, Chunying Song, Yanhong Luo, Yuehua Cui, Xianming Hu, Yanbo Zhang*. Screening high-risk clusters for developing birth defects in mothers in Shanxi Province[J].BMC Pregnancy and Childbirth, 2015,15:343.

12.賈聰聰,杜港,趙鑫,師國京,房瑞玲,李治,張巖波,曹紅艷*.基于生存結局加權多組學數據整合的膠質瘤分子分型[J].中國衛生統計, 2024, 41(05): 644-649.

13.師國京,李靈梅,魏億芳,趙鑫,房瑞玲,楊海濤,余紅梅,張巖波,曹紅艷*.網絡增強核融合方法的改進及其在乳頭狀腎細胞癌多組學數據整合分子分型中的應用[J].中國衛生統計, 2024, 41(3): 376-381.

14.趙鑫,魏億芳,李靈梅,師國京,房瑞玲,曹紅艷*.基于MOVICS集成聚類的低級別膠質瘤多組學數據整合分子分型[J].中華疾病控制雜志, 2023, 27(2):216-223.

15.李靈梅,魏億芳,李治,房瑞玲,崔躍華*,曹紅艷*.基于rMKL-LPP方法的乳頭狀腎細胞癌多組學數據整合分型分析[J].中國衛生統計, 2022, 39(4): 522-528.

16.魏億芳,李靈梅,李治,房瑞玲,曹紅艷*,崔躍華*.基于多組學數據的透明細胞腎細胞癌預后分子分型研究[J].中華疾病控制雜志, 2022, 26(3): 315-324.

17.武永清,郭志飛,房瑞玲,李 治,曹紅艷*,崔躍華*.基于相似核融合的多組學數據結直腸癌分子亞型研究[J].中國衛生統計, 2021, 38(5):650-655,660.

18.王碧玨,郭志飛,楊海濤,李 治,王菊平,曹紅艷*,周立業*.基于因果推斷方法檢驗mRNA在年齡和低級別膠質瘤中的中介效應[J].中國衛生統計,2020,37(6):840-843,847.

19.郭志飛,王碧玨,楊海濤,李 治,王菊平,曹紅艷*,周立業*.基于加權隨機森林的三陰性乳腺癌microRNA組學數據的分類預測[J].中國衛生統計, 2020, 37(6):809-812,817.

20.王慧慧,薩 建,曹紅艷*,崔躍華*.基于時間序列的急性髓系白血病融合基因表達網絡差異分析[J].中華疾病控制雜志, 2020,24(3):275-278,289.

21.曹紅艷,曾 平,李 治,崔躍華,張巖波*.懲罰廣義估計方程在縱向數據基因關聯分析中的應用[J].中國衛生統計, 2017, 34(4): 534-537.

22.曹紅艷,羅艷虹,張巖波*.衛生統計學貫通式教學方法的應用[J].中國衛生統計, 2017, 34(2): 355-357.

23.曹紅艷,馬 靖,李 治,張巖波*.基于隱馬爾可夫模型對原核生物編碼序列的識別[J].中國衛生統計, 2015, 32(2):254-256.

24.范宇暉,王孟卓,樊寧寧,曹紅艷*,郭東星*.腦卒中發病與環境因素的相關性分析[J].數理醫藥學雜志, 2013, 26(6): 692-695.




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